Elle partage sa vie depuis 2016 avec le ministre de la Justice français Éric Dupond-Moretti, qui a un fils prénommé Raphaël.
En effet, Raphaël, qui est donc le beau-fils d’Isabelle, a été mis en garde à vue pour des soupçons de violence conjugale.
Raphaël Dupond-Moretti aurait été violent avec sa conjointe, et il se serait rendu lui-même aux autorités.
Son père, le conjoint d’Isabelle Boulay, a réagi peu de temps après avoir appris la nouvelle. Voici ce qu’il a mentionné :
« En tant que père, je suis dévasté. J’ai une pensée pour la victime. Chaque violence, quelle qu’elle soit, est intolérable. »
« En tant que ministre, je n’ai cessé de lutter contre les violences faites aux femmes et pour que leur parole soit prise en compte. En tant que citoyen, je demande qu’on respecte ma vie familiale. Il appartient désormais à la Justice de faire son travail »